感染
很長一段時間以來，醫學科學一直認為傳染病是由病原體的存在和感染者或宿主的虛弱引起的，這使得病原體得以生長和感染。 例如，弱點可能是由遺傳疾病或免疫抑制治療（例如用於移植患者的免疫抑制治療）引起的免疫系統減弱。
我們假設我們的身體內部大部分是無菌環境，我們可能生病的一個原因可能是病原體進入其中一個無菌區域，然後不受控制地生長。 其中一個無菌區域是我們的肺——所以 30 到 40 年前，大多數人會得出結論，曲霉菌病是由一種 曲霉 孢子深入受體的肺部，然後設法生長。
微生物
大約在 2000 年左右，我們開始能夠更詳細地觀察我們的內部空間並識別可能存在的任何微生物。所發現的令人驚訝，例如，我們可以找到許多微生物； 細菌、真菌和病毒在我們的肺部生長而不會引起任何有害症狀。 發現很常見 煙曲霉（Aspergillus fumigatus） （即我們認為大多數時候會引起曲霉病的病原體）存在於我們大多數人的肺部，它生活的地方不會引起曲霉病。 這怎麼可能？這種情況與曲霉菌病患者肺部引起的過敏和感染有什麼區別？
我們很快了解到，微生物可以建立無害群落，彼此和諧相處，並與我們的免疫系統和諧相處。 這個社區被命名為人類 微生物 並包括生活在我們體內和我們身上的所有微生物。 大量生活在我們的腸道中，特別是在我們的大腸中，大腸是我們消化系統的最後一部分，在食物通過直腸排出之前接收食物。
我們的微生物朋友
那時就出現了 煙曲霉 可以由它的微生物鄰居（我們的微生物組）控制，與我們的免疫系統密切控制合作。
真菌病原體與宿主相互作用以平息宿主對病原體的反應，並利用宿主的部分免疫系統來做到這一點。 通過這種方式，宿主和病原體相互容忍並且幾乎沒有傷害，然而，已經證明，如果宿主的真菌識別系統的某些部分不起作用，那麼宿主將引發侵襲性炎症反應。 這與 ABPA 的情況沒有什麼不同，其中一個主要問題是 宿主對真菌反應過度.
我們還舉了一個微生物組控制宿主對真菌病原體的免疫反應的例子。 腸道中的微生物群感應到一個信號（可能是在宿主攝入的食物中），可以增加對感染的抵抗力。 這意味著環境因素會影響其微生物鄰居對病原體的排斥——我們可能從中得到的信息是看 在我們的腸道微生物群之後，它會照顧我們。 這也適用於我們肺部的微生物，我們已經看到上呼吸道和下呼吸道中細菌的類型和位置存在差異，這似乎與控制炎症的微生物組一致——作者推測我們需要看看會發生什麼當我們用高度炎性病原體挑戰這些肺部微生物群時，例如 煙曲霉（Aspergillus fumigatus）.
只要保持健康，微生物組也會自我調節。 細菌可以攻擊真菌，真菌可以在持續的食物爭奪戰中攻擊細菌。 宿主病原體可以被其他微生物完全從微生物組中消除.
我們身體不同部位的不同微生物組可以相互作用和控制哮喘等疾病（即肺微生物組與腸道微生物組相互作用）——所以 你吃的東西可能會影響你腸道微生物群中的微生物，這可能會影響你的哮喘， 例如。
我必須警告你，上面提到的許多觀察結果都是基於迄今為止很少的實驗，而且主要是基於動物模型系統和 念珠菌 而非 曲霉 所以我們在解釋曲霉菌病時必須謹慎，但是有一些重要的信息值得牢記。
- 大多數健康人似乎都擁有非常健康、高度多樣化的微生物群——因此，請通過含有大量植物材料、大量纖維的均衡飲食來照顧您的微生物群
- 研究人員似乎正在改變我們對什麼是感染的假設——他們似乎是在說炎症導致感染，而不是感染導致炎症。
- 你吃的東西會直接影響你的身體使用的炎症量，以應對它認為是病原體的東西。
哮喘和 ABPA 之類的疾病不會是由不健康的微生物組引起的吧？
目前的研究似乎表明它可能發揮了作用，因此曲霉菌病患者盡其所能促進自身健康的微生物群落的價值怎麼強調都不為過。