感染
很长一段时间以来，医学科学一直认为传染病是由病原体的存在和感染者或宿主的虚弱引起的，这使得病原体得以生长和感染。 例如，弱点可能是由遗传疾病或免疫抑制治疗（例如用于移植患者的免疫抑制治疗）引起的免疫系统减弱。
我们假设我们的身体内部大部分是无菌环境，我们可能生病的一个原因可能是病原体进入其中一个无菌区域，然后不受控制地生长。 其中一个无菌区域是我们的肺——所以 30 到 40 年前，大多数人会得出结论，曲霉菌病是由一种 曲霉 孢子深入受体的肺部，然后设法生长。
微生物
大约在 2000 年左右，我们开始能够更详细地观察我们的内部空间并识别可能存在的任何微生物。所发现的令人惊讶，例如，我们可以找到许多微生物； 细菌、真菌和病毒在我们的肺部生长而不会引起任何有害症状。 发现很常见 烟曲霉 （即我们认为大多数时候会引起曲霉病的病原体）存在于我们大多数人的肺部，它生活的地方不会引起曲霉病。 这怎么可能？这种情况与曲霉菌病患者肺部引起的过敏和感染有什么区别？
我们很快了解到，微生物可以建立无害群落，彼此和谐相处，并与我们的免疫系统和谐相处。 这个社区被命名为人类 微生物 并包括生活在我们体内和我们身上的所有微生物。 大量生活在我们的肠道中，尤其是在我们的大肠中，大肠是我们消化系统的最后一部分，在食物通过直肠排出之前接收食物。
我们的微生物朋友
那时就出现了 A. fumigatus 可以由它的微生物邻居（我们的微生物组）控制，与我们的免疫系统密切控制合作。
真菌病原体与宿主相互作用以平息宿主对病原体的反应，并利用宿主的部分免疫系统来做到这一点。 通过这种方式，宿主和病原体相互容忍并且几乎没有伤害，然而，已经证明，如果宿主的真菌识别系统的某些部分不起作用，那么宿主将引发侵袭性炎症反应。 这与 ABPA 的情况没有什么不同，其中一个主要问题是 宿主对真菌反应过度.
我们还举了一个微生物组控制宿主对真菌病原体的免疫反应的例子。 肠道中的微生物群感应到一个信号（可能是在宿主摄入的食物中），可以增加对感染的抵抗力。 这意味着环境因素会影响其微生物邻居对病原体的排斥——我们可能从中得到的信息是看 在我们的肠道微生物群之后，它会照顾我们。 这也适用于我们肺部的微生物，我们已经看到上呼吸道和下呼吸道中细菌的类型和位置存在差异，这似乎与控制炎症的微生物组一致——作者推测我们需要看看会发生什么当我们用高度炎性病原体挑战这些肺部微生物群时，例如 烟曲霉.
只要保持健康，微生物组也会自我调节。 细菌可以攻击真菌，真菌可以在持续的食物争夺战中攻击细菌。 宿主病原体可以被其他微生物完全从微生物组中消除.
我们身体不同部位的不同微生物组可以相互作用和控制哮喘等疾病（即肺微生物组与肠道微生物组相互作用）——所以 你吃的东西可能会影响你肠道微生物群中的微生物，这可能会影响你的哮喘，例如。
我必须警告你，上面提到的许多观察结果都是基于迄今为止很少的实验，而且主要是基于动物模型系统和 念珠菌 而非 曲霉 所以我们在解释曲霉菌病时必须谨慎，但是有一些重要的信息值得牢记。
- 大多数健康的人似乎都拥有非常健康、高度多样化的微生物群——因此，请通过含有大量植物材料、大量纤维的均衡饮食来照顾您的微生物群
- 研究人员似乎正在改变我们对什么是感染的假设——他们似乎是在说炎症导致感染，而不是感染导致炎症。
- 你吃的东西会直接影响你的身体使用的炎症量，以应对它认为是病原体的东西。
哮喘和 ABPA 之类的疾病不会是由不健康的微生物组引起的吧？
目前的研究似乎表明它可能发挥了作用，因此曲霉菌病患者尽其所能促进自身健康的微生物群落的价值怎么强调都不为过。