Infection

Pendant très longtemps, la science médicale a supposé que les maladies infectieuses étaient causées par la présence d'un agent pathogène et la faiblesse de la personne infectée ou de l'hôte, comme on l'appelle souvent, ce qui permet à l'agent pathogène de se développer et de s'infecter. La faiblesse pourrait être par exemple un système immunitaire affaibli causé par une maladie génétique ou un traitement immunosuppresseur tel qu'il est utilisé pour les patients transplantés.

Nous avons supposé qu'à l'intérieur de notre corps, il y avait principalement un environnement stérile, et l'une des raisons pour lesquelles nous pourrions tomber malades pourrait être qu'un agent pathogène pénètre dans l'une de ces zones stériles et se développe ensuite de manière incontrôlable. L'une de ces zones stériles était nos poumons - il y a 30 à 40 ans, la plupart auraient conclu que l'aspergillose était causée par un Aspergillus spore pénétrant profondément dans les poumons du receveur et réussissant ensuite à se développer.

Microbiome

Vers l'an 2000, nous avons commencé à être en mesure d'examiner nos espaces internes plus en détail et d'identifier les microbes qui pourraient être présents. Ce qui a été trouvé a été une surprise, par exemple, nous avons pu trouver de nombreux microbes ; bactéries, champignons et virus se développant dans nos poumons sans provoquer de symptômes nocifs. Il est courant de trouver Aspergillus fumigatus (c'est-à-dire l'agent pathogène qui, selon nous, cause l'aspergillose la plupart du temps) présent dans les poumons de la plupart d'entre nous où il vit sans provoquer d'aspergillose. Comment est-ce possible et quelle est la différence entre cette situation et l'allergie et les infections causées dans les poumons d'un patient atteint d'aspergillose ?

Nous avons rapidement appris que les microbes pouvaient établir des communautés inoffensives, vivant en harmonie les unes avec les autres et avec notre système immunitaire. Cette communauté a été nommée l'humain microbiome et inclus tous les microbes qui vivent en nous et sur nous. Un grand nombre vit dans notre intestin, en particulier dans notre gros intestin qui est la dernière section de notre système digestif à recevoir notre nourriture avant qu'elle ne soit éjectée par le rectum.

Nos amis microbiens

Il est apparu alors que A. fumigatus peut être contrôlé par ses voisins microbiens (notre microbiome) travaillant dans un partenariat étroitement contrôlé avec notre système immunitaire.

L'agent pathogène fongique interagit avec l'hôte pour calmer la réponse de l'hôte à l'agent pathogène et utilise des parties du système immunitaire de l'hôte pour ce faire. De cette façon, l'hôte et l'agent pathogène se tolèrent et font peu de mal, cependant, il a été démontré que si des parties du système de reconnaissance fongique de l'hôte ne fonctionnent pas, l'hôte déclenchera une réponse inflammatoire agressive. Ce n'est pas sans rappeler la situation à l'ABPA où l'un des problèmes majeurs est la hôte réagissant de manière excessive au champignon.

On nous donne également un exemple du microbiome contrôlant la réponse immunitaire de l'hôte à un pathogène fongique. La résistance à l'infection peut être augmentée par la population microbienne dans l'intestin détectant un signal - vraisemblablement dans les aliments ingérés par l'hôte. Cela signifie que les facteurs environnementaux peuvent influencer le rejet d'un agent pathogène par ses voisins microbiens - le message que nous pourrions en tirer est de regarder après notre microbiome intestinal, et il prendra soin de nous. Cela vaut également pour les microbes dans nos poumons, où nous avons observé des différences dans les types et l'emplacement des bactéries dans les voies respiratoires supérieures et inférieures qui semblent être compatibles avec le microbiome contrôlant l'inflammation - les auteurs pensent que nous devons regarder ce qui se passe lorsque l'on défie ces microbiotes pulmonaires avec un agent pathogène hautement inflammatoire tel que Aspergillus fumigatus.

Le microbiome s'autorégule aussi tant qu'il est maintenu en bonne santé. Les bactéries peuvent attaquer les champignons, les champignons peuvent attaquer les bactéries dans une bataille continue pour la nourriture. Les agents pathogènes de l'hôte peuvent être complètement éliminés du microbiome par d'autres microbes.

Différents microbiomes dans une partie différente de notre corps peuvent interagir et contrôler des maladies telles que l'asthme (c'est-à-dire le microbiome pulmonaire interagissant avec le microbiome intestinal) - donc ce que vous mangez peut influencer les microbes de votre microbiote intestinal et cela peut avoir un impact sur votre asthme, Par exemple.

Je dois vous avertir que bon nombre des observations mentionnées ci-dessus sont basées sur très peu d'expériences jusqu'à présent, et principalement sur des systèmes de modèles animaux et Candidose plutôt que Aspergillus nous devons donc être prudents dans notre interprétation en ce qui concerne l'aspergillose, mais il y a quelques messages à retenir qu'il convient de garder à l'esprit.

1. La plupart des personnes en bonne santé semblent avoir des microbiomes très sains et très diversifiés - alors prenez soin du vôtre avec une alimentation bien équilibrée contenant beaucoup de matière végétale, beaucoup de fibres
2. Les chercheurs semblent renverser nos hypothèses sur ce qu'est l'infection - ils semblent dire que l'inflammation provoque l'infection, plutôt que l'infection provoque l'inflammation.
3. Ce que vous mangez peut avoir un impact direct sur la quantité d'inflammation que votre corps utilise en réponse à ce qu'il perçoit comme un agent pathogène.

Il est impossible que des maladies comme l'asthme et l'ABPA soient causées par un microbiome malsain, n'est-ce pas ?

Les recherches actuelles semblent suggérer que cela pourrait jouer un rôle, de sorte que la valeur d'une personne atteinte d'aspergillose faisant ce qu'elle peut pour promouvoir une communauté saine de microbes en elle-même ne peut être surestimée.

Que dois-je manger pour un microbiome sain ? (Site de la BBC)

Projet sur le microbiome humain

Régulation médiée par le microbiome de l'immunité antifongique