L'importance des microbiomes

Les microbiomes sont tous les micro-organismes (bactéries, champignons, virus, etc.) présents dans une zone particulière du corps. Ceux-ci se trouvent dans des endroits tels que l'intestin, les poumons et la bouche et les microbiomes dans différentes zones sont constitués d'une distribution différente d'espèces. Ils sont bénéfiques pour notre corps et influencent un large éventail de choses telles que notre système immunitaire, notre santé mentale et notre santé respiratoire. Chez la personne moyenne en bonne santé, ces différentes espèces existent dans un équilibre régulé pour remplir diverses fonctions et conférer des avantages pour la santé - elles fournissent des nutriments que nous ne pouvons pas fabriquer nous-mêmes. Un déséquilibre (appelé dysbiose) entre les espèces de micro-organismes présents est fortement associé à la maladie.

En savoir plus sur les microbiomes sur cette page – https://aspergillosis.org/the-host-its-microbiome-and-their-aspergillosis/?highlight=microbiomes

Le microbiome intestinal – santé mentale et système immunitaire

Le microbiote le plus étudié est celui de l'intestin. Dans l'intestin, il y a environ 100 billions (100 000 000 000 000 !) de bactéries d'environ 1000 espèces différentes. Ces bactéries peuvent communiquer avec le cerveau via ce qu'on appelle l'axe microbiote-intestin-cerveau, qui décrit une interaction bidirectionnelle entre le cerveau et l'intestin. L'intestin est capable d'envoyer des messages au cerveau sous la forme de substances chimiques (appelées neurotransmetteurs) qui voyagent le long des nerfs et à travers la circulation sanguine pour atteindre le cerveau où ils ont divers effets. Ces neurotransmetteurs sont produits par des bactéries qui vivent dans l'intestin.

Le microbiote intestinal est un régulateur des niveaux de stress et d'anxiété et a une forte influence sur l'humeur et la dépression. Cela a été démontré par plusieurs études. Par exemple, des études sur des souris ont montré que celles qui n'ont pas de microbiome intestinal (appelées souris sans germes) ont une réponse au stress anormalement forte par rapport aux souris qui ont un microbiome intestinal.[1]. Fait intéressant, cette réponse accrue a été réduite après l'ajout d'une bactérie intestinale résidente appelée Bifidobacterium. Cette espèce, ainsi qu'une autre espèce clé appelée Lactobacillus, a été montré pour réduire considérablement l'anxiété chez l'homme[2]. La transplantation de microbiote fécal (FMT) est un processus par lequel les matières fécales d'un donneur sain sont transplantées chez un receveur pour rétablir l'équilibre des bactéries dans son intestin. Des expériences de FMT ont été réalisées à partir de patients en bonne santé jusqu'à ceux présentant des symptômes dépressifs et anxieux et vice versa ; dans tous les cas, les patients malades ont signalé une réduction des symptômes après avoir reçu la greffe et les patients en bonne santé ont signalé une augmentation des symptômes[3]. Enfin, la sérotonine est une hormone qui agit dans le cerveau pour provoquer une humeur positive et heureuse. Cette hormone est produite par des bactéries intestinales et, en fait, environ 90 % de la sérotonine du corps est fabriquée par ces bactéries.[4]. Ce ne sont que quelques exemples qui démontrent les impacts des bactéries intestinales sur la santé mentale.

Pour en savoir plus sur l'impact du microbiome intestinal sur la santé mentale, consultez cet article de la BBC - https://bbc.in/3npHwet

Notre système immunitaire (c'est-à-dire le système qui nous aide à combattre les infections) est également affecté par le microbiote intestinal. Diverses bactéries intestinales sont capables de stimuler les cellules immunitaires (cellules T) pour qu'elles se spécialisent dans un type spécifique de cellules appelées cellules régulatrices T (ou Tregs). Les Tregs suppriment le système immunitaire et, par conséquent, des réactions allergiques exagérées (par exemple, l'eczéma) peuvent se développer à partir d'une activation réduite de ces cellules immunitaires. Dans l'intestin, certaines bactéries sont capables d'activer les Tregs. Cela suggère la possibilité d'administrer ces espèces aux patients présentant des réponses allergiques hyperactives pour aider à soulager les allergies et l'inflammation. Cette hypothèse donne des premiers résultats encourageants, par exemple dans l'eczéma, https://nationaleczema.org/topical-microbiome/. Voir aussi la section à la fin sur les probiotiques.

Microbiomes pulmonaires et intestinaux – allergie et asthme

Les voies respiratoires inférieures abritent une population différente de micro-organismes, appelée microbiome pulmonaire. La composition de ce microbiome est différente de celle de l'intestin. Il y a beaucoup moins de bactéries présentes dans les poumons que dans l'intestin et cet environnement est beaucoup plus difficile à étudier, principalement parce que les méthodes d'obtention d'échantillons pulmonaires sont invasives. On croyait initialement que les poumons étaient un environnement stérile ne contenant aucune bactérie et le microbiome pulmonaire n'a été découvert que ces dernières années, par conséquent, on en sait beaucoup moins sur cette population par rapport à l'intestin.

Ce que l'on sait, c'est que le microbiome pulmonaire joue un rôle dans la santé respiratoire et qu'une diversité réduite d'espèces microbiennes est associée à la maladie - une plus grande réduction de la diversité étant associée à une maladie plus grave. Il est important de noter que le microbiome pulmonaire est connecté au microbiome intestinal par l'axe poumon-intestin et que les maladies respiratoires et gastro-intestinales sont souvent présentes ensemble. Les deux sont liés par le système immunitaire et la communication se produit, comme avec l'intestin et le cerveau, par le biais de messagers chimiques. Cela signifie que les modifications du microbiote intestinal semblent également avoir un effet sur les réactions allergiques des voies respiratoires et sur l'asthme. Plusieurs études ont montré que les patients asthmatiques ont une gamme modifiée d'espèces dans leurs microbiomes pulmonaires et intestinaux par rapport à une personne non asthmatique, et on pense que ce déséquilibre contribue à l'hypersensibilité et à l'hyperréactivité du système immunitaire.

Une espèce bactérienne appelée Bacteroides fragilis (B. fragilis) a été montré dans des modèles expérimentaux de souris (destinés à simuler l'asthme) pour réguler l'équilibre entre le type de réponse immunitaire que le corps produit[5]. Les réponses inflammatoires allergiques sont produites par une voie spécifique (appelée voie Th2) tandis que les réponses immunitaires non allergiques sont produites par une voie différente (Th1). Cette espèce de bactérie est importante car elle contrôle l'équilibre entre ces deux voies pour garantir qu'aucune des réponses ne devienne dominante. B. fragilis repose sur un glucide appelé N-glycane et la production de N-glycane est réduite chez les patients souffrant d'asthme sévère[6]. Cela rend plus difficile pour B. fragilis de se développer, il est donc plus probable qu'une réponse allergique (Th2) puisse dominer à mesure que l'équilibre entre les deux voies devient moins régulé. Ceci est un exemple de l'importance des bactéries intestinales dans une maladie comme l'asthme allergique.

Cliquez sur ce lien pour en savoir plus sur la connexion intestin-poumon et sa pertinence dans COVID-19 - https://bit.ly/3FooPOp

L'avenir – probiotiques, FMT et recherche

Les probiotiques sont définis comme « des micro-organismes vivants qui, lorsqu'ils sont administrés en quantités adéquates, confèrent un avantage pour la santé à l'hôte (la personne) ». Ils se présentent sous différentes formes et sont pris pour divers avantages pour la santé, différents ayant différentes compositions de bactéries.

Les probiotiques ont été étudiés ces dernières années pour une utilisation chez les patients asthmatiques présentant une sensibilisation allergique. Certaines expériences ont été faites pour tester les probiotiques comme traitement de l'asthme et se sont avérées fructueuses. Par exemple, une étude a donné des probiotiques à 160 enfants asthmatiques âgés de 6 à 18 ans sous forme de gélules pendant 3 mois ; les résultats ont montré que les patients avaient réduit la gravité de l'asthme, amélioré le contrôle de l'asthme, augmenté le débit expiratoire de pointe et diminué les taux d'IgE (un marqueur d'allergie)[7]. Notamment, de nombreuses études réalisées sur ce sujet ont été menées sur des souris ou des enfants et les résultats sont incohérents. Des recherches supplémentaires sont donc nécessaires dans ce domaine avant que les probiotiques puissent être recommandés comme traitement.

La FMT est un traitement efficace établi pour Clostridium difficile infections, mais les expériences n'ont pas encore été complètement étudiées dans les maladies allergiques. Il y a actuellement un essai clinique en cours pour la FMT encapsulée par voie orale dans le traitement de l'allergie aux arachides et la phase I est terminée mais les résultats n'ont pas encore été publiés. Au fur et à mesure que ces essais deviendront plus nombreux, il est probable qu'ils s'étendront à l'asthme allergique et peut-être même à Aspergillus-sensibilisation. Dans l'état actuel des choses, il existe une certaine résistance à de tels essais, car certaines personnes s'opposent à l'idée de transférer des selles d'une personne à une autre ou sont «dégoûtées» par celle-ci. Cependant, en réalité, la FMT n'est pas une greffe de fèces, mais de microbiote intestinal. De plus, tous les essais de FMT n'ont pas eu de résultats positifs - un essai chez des patients ayant reçu une greffe de cellules souches hématopoïétiques s'est avéré fatal pour un homme qui a reçu un échantillon de donneur qui n'avait pas été testé pour un type de virus résistant aux médicaments. E. coli [8]. La recherche FMT sur les allergies en est encore à ses débuts et des recherches supplémentaires sont nécessaires pour garantir sa sécurité, mais il ne fait aucun doute qu'elle a un grand potentiel pour l'avenir.

Néanmoins, le maintien d'un équilibre sain de bactéries dans vos microbiomes intestinaux et pulmonaires est important pour la santé et le bien-être de chacun. Ceci est facilité par le fait d'avoir un alimentation saine et équilibrée contenant beaucoup de fibres et manger des aliments qui contiennent beaucoup de bactéries bénéfiques comme le yaourt nature ou le kéfir. Bien qu'ils ne soient pas auparavant recommandés comme traitement par le NHS, vous voudrez peut-être envisager prendre un probiotique. Cependant, vous devez savoir que les probiotiques sont considérés comme des compléments alimentaires par opposition aux médicaments et que la fabrication de ces produits n'est donc pas réglementée, ce qui signifie que vous ne pouvez pas être certain qu'ils contiennent les bactéries indiquées sur l'étiquette. Il convient également de noter que les probiotiques utilisés dans les essais cliniques sont susceptibles d'être plus efficaces que ceux qui peuvent être achetés sans ordonnance car ils contiennent probablement une dose plus élevée et plus d'espèces.

Il existe de bonnes preuves que la prise d'un probiotique tout en prenant des antibiotiques est efficace pour réduire la diarrhée associée aux antibiotiques, mais encore une fois, ce n'est pas encore un traitement recommandé. Les principales espèces à surveiller sont Lactobacillus (L) rhamnosus. L. acidophilus et L. casei. En outre, Bifidobacterium (B) lactis et Saccharomyces (S) boulardii. Pour que ces probiotiques soient efficaces, une dose de 10 milliards (10^10) d'ufc (bactéries) est nécessaire. Si le produit n'indique pas le dosage, il est probable qu'il ne contienne pas suffisamment de bactéries pour avoir un effet significatif. De plus, une dose bien supérieure à 10 milliards n'est pas bénéfique et peut avoir des effets néfastes sur la santé tels que des douleurs abdominales. Une étude réalisée aux Pays-Bas a compilé une liste de probiotiques recommandés par divers fabricants pour le traitement de la diarrhée lors de la prise d'antibiotiques. Cette étude n'a pas été réalisée au Royaume-Uni, donc tous ces probiotiques ne sont peut-être pas disponibles ici, mais cela vaut la peine d'être vu. Voir cette liste ici. Notez qu'une note de trois étoiles est la meilleure, mais une note d'une étoile vaut toujours la peine d'être recommandée.

Pour conclure, nous savons que les microbiomes sont extrêmement importants pour notre santé, alors prenez soin du vôtre autant que vous le pouvez.

Vous voulez savoir quoi manger pour un intestin sain ? Suivez ce lien - https://bbc.in/31Rhfx1

 

[1] https://physoc.onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1113/jphysiol.2004.063388

[2] https://www.cambridge.org/core/journals/british-journal-of-nutrition/article/assessment-of-psychotropiclike-properties-of-a-probiotic-formulation-lactobacillus-helveticus-r0052-and-bifidobacterium-longum-r0175-in-rats-and-human-subjects/2BD9977C6DB7EA40FC9FFA1933C024EA

[3] https://bmcpsychiatry.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12888-020-02654-5

[4] https://ieeexplore.ieee.org/document/8110878

[5] https://academic.oup.com/glycob/article/25/4/368/1988548

[6] https://www.researchgate.net/publication/233880834_Transcriptome_analysis_reveals_upregulation_of_bitter_taste_receptors_in_severe_asthmatics

[7] Efficacité de l'administration de Lactobacillus chez les enfants d'âge scolaire souffrant d'asthme : un essai randomisé contrôlé par placebo - PubMed (nih.gov)

[8] https://www.nejm.org/doi/full/10.1056/NEJMoa1910437?query=featured_home