Au cours des dernières années, les cliniciens et les chercheurs ont réalisé que les interactions entre les micro-organismes dans les infections polymicrobiennes (lorsqu'un seul patient est colonisé/infecté par deux agents pathogènes ou plus) sont pertinentes pour la progression de la maladie. Les contacts entre les agents pathogènes peuvent affecter leur condition physique (comment ils peuvent se développer à l'intérieur de nous) et également avoir un impact sur la réponse de notre système immunitaire. Cependant, la recherche dans ce domaine nouveau et extrêmement complexe en est encore à ses balbutiements et nous devons obtenir beaucoup plus d'informations avant de pouvoir comprendre ce qui se passe dans chaque condition spécifique. On soupçonne que dans certaines interactions, les micro-organismes peuvent entrer en compétition les uns avec les autres, ce qui est généralement bon pour nous. Cependant, dans d'autres types d'interactions, les agents pathogènes peuvent s'entraider, ce qui est bien sûr préjudiciable aux patients. Dans le cas de Aspergillus – Pseudomonas interaction, il n'est pas encore tout à fait clair ce qui se passe, une interaction positive ou négative.

Pseudomonas (principalement les espèces Pseudomonas aeruginosa) est une bactérie pathogène commune et Aspergillus (principalement les espèces Aspergillus fumigatus) est l'agent pathogène fongique le plus courant des voies respiratoires humaines. Les deux organismes sont capables de se développer dans les poumons des personnes immunodéprimées et également des patients atteints de certaines maladies sous-jacentes, telles que la bronchectasie, la maladie pulmonaire obstructive chronique (MPOC), la pneumonie nosocomiale et la fibrose kystique. Étant donné que la prise de conscience de l'importance des infections polymicrobiennes est assez récente, il n'y a pas encore beaucoup de rapports sur l'incidence de la co-infection avec ces deux agents pathogènes. L'un des rares, dès fin 2018, rapporte une prévalence de co-infection chez les patients atteints de mucoviscidose de 15.8 % (1). Cela signifie que près de seize pour cent de tous les patients atteints de mucoviscidose peuvent être co-infectés par les deux Pseudomonas et Aspergillus… Ce n'est bien sûr pas anodin !

 Plusieurs études menées dans divers laboratoires à travers le monde suggèrent que l'interaction entre Aspergillus et Pseudomonas est de nature compétitive. Cela indiquerait qu'ils s'affaiblissent lors de la co-infection, ce qui pourrait être une bonne nouvelle pour les patients. Cependant, il existe également des résultats, y compris des preuves cliniques, qui suggèrent le contraire, les agents pathogènes pourraient s'entraider dans les poumons humains. Ce qui semble clair, c'est que la présence des deux agents pathogènes n'est pas bonne pour les patients (2). Par conséquent, nous devons comprendre comment ces microbes interagissent lors de la co-infection pour pouvoir décider quelle ligne de conduite est la meilleure, doit-on traiter contre les deux ou un seul ? Lequel en premier, ou les deux à la fois ?

Pour répondre à ces questions, mon groupe de recherche, au sein du Manchester Fungal Infection Group, tente de comprendre les interactions spécifiques qui ont lieu entre Aspergillus fumigatus et Pseudomonas aeruginosa dans des conditions similaires à la co-infection du poumon humain.

Nous voulons découvrir quelles interactions sont les plus importantes. Cela nous aidera à comprendre ce qui se passe pendant la co-infection et nous pourrons ensuite utiliser ces connaissances pour améliorer la prise en charge et le traitement des patients.

Docteur Jorge Amich | Boursier en développement de carrière du CRM

Groupe des infections fongiques de Manchester (MFIG)

1. Zhao J, Cheng W, He X, Liu Y.2018. La prévalence de la co-colonisation de Pseudomonas aeruginosa et Aspergillus fumigatus dans la fibrose kystique : une revue systématique et une méta-analyse. Microb Pathog 125:122-128.

2. Reece E, Segurado R, Jackson A, McClean S, Renwick J, Greally P.2017. Co-colonisation avec Aspergillus fumigatus et Pseudomonas aeruginosa est associée à une moins bonne santé chez les patients atteints de mucoviscidose : une analyse du registre irlandais. BMC Pulm Med 17h70.